R の基礎、R による統計解析 (遺伝子発現解析など) 講習会

• 日程: 2020 年 12 月 16 日 (水) ～ 17 日 (木)
• 講義時間: 10 時 00 分 ～ 17 時 00 分 (両日) (※どちらかでも参加可能ですが、二日間セットの講習となりますので、できるだけ両日ご参加ください)
• 会場: Webex によるオンライン開催
• 対象: SHIROKANE 利用者 (SHIROKANE のアカウントがない方は、SHIROKANE を利用した実習の際はご覧いただくのみになります)
• 定員: 50 名
• 参加費: 無料
• 本講習会は日本語で実施します

講習題目

R の基礎、R による統計解析 (遺伝子発現解析など)

講師

名古屋大学 大学院医学系研究科 松井 佑介 准教授

講習内容

統計解析言語 R は、基礎的な統計処理から先進的な統計手法まで幅広い機能を備え、それらのグラフィカル描画をも簡便に実現している使いやすく汎用性に富む統計解析プログラミング言語です。フリーソフトでもあり、科学研究分野でも広く利用されています。

このたびの二日間の講習会では、統計解析言語 R の入門に加え、遺伝子・タンパク発現データ等の実データを用いた統計解析、バイオインフォマティクスに関する説明と実習を含みます。本講習会では、講習会で取り上げる課題を参加者が自ら実際に実行していく実習を重視します。参加者の自身の研究活動において、本講習で学習した知識をすぐに実践できるようになることを心がけます。

申込み方法

12 月 16 日 (水) 10:00 までに下記フォームからお申込みください。登録いただいたメールアドレスに Webex の URL をご連絡します。

システム上、チケットの販売といった表記となりますが無償の講習会です。

講習会開催中のご質問は、Webex のチャットで受付いたします。

講習会に参加される方は、事前に RStudio Cloud (Free plan) のアカウント作成と、R パッケージのインストールをお願いいたします。

* RStudio Cloud  https://rstudio.cloud/plans/free

R パッケージ インストール手順

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1. RStudio Cloud にログインする

2. RStudio Cloud の console 画面で以下のコマンドを実行 (※RStudio Cloud の console 画面に下記のコマンドをコピー & ペーストしたい場合は、Ctrl キーを押しながら V キーを押します)

install.packages(c("RColorBrewer",

                   "devtools",

                   "BiocManager",

                   "survival",

                   "survminer",

                   "pheatmap",

                  "data.table",

                  "gplots",

                  "readxl",

                  "ggplot2",

                  "GGally"

))

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SHIROKANE では、講習会用の R と R パッケージをご利用いただきます。

ご自身で SHIROKANE のホームディレクトリにソフトウェアをインストールする必要はございません。

ご不明な点がございましたら、SHIROKANE サポート係までお問い合わせください。

皆様のご参加をお待ちしています。